Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
GRIN2AQ12879 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC39.2■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
GRIN2AQ12879 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC39.18■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.16■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC39.15■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.14■■■■□ 3.86
GRIN2AQ12879 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.13■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.09■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC39.07■■■■□ 3.85
GRIN2AQ12879 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC39.05■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC39.05■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC39.05■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.02■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
GRIN2AQ12879 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC39■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.99■■■■□ 3.83
GRIN2AQ12879 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms