Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGL1

LAMTOR4, Ragulator complex protein LAMTOR4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4Q0VGL1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMTOR4Q0VGL1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMTOR4Q0VGL1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMTOR4Q0VGL1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LAMTOR4Q0VGL1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMTOR4Q0VGL1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LAMTOR4Q0VGL1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LAMTOR4Q0VGL1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LAMTOR4Q0VGL1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms