Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CYP4F3Q08477 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CYP4F3Q08477 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CYP4F3Q08477 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CYP4F3Q08477 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms