Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GABPB1Q06547 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GABPB1Q06547 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABPB1Q06547 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms