Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3AQ05086 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3AQ05086 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBE3AQ05086 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms