Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
EFNB1P98172 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFNB1P98172 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
EFNB1P98172 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
EFNB1P98172 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNB1P98172 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNB1P98172 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNB1P98172 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNB1P98172 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNB1P98172 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNB1P98172 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
EFNB1P98172 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNB1P98172 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.32■■□□□ 1
EFNB1P98172 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
EFNB1P98172 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFNB1P98172 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
EFNB1P98172 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNB1P98172 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNB1P98172 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNB1P98172 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.31■■□□□ 1
EFNB1P98172 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNB1P98172 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNB1P98172 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNB1P98172 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
EFNB1P98172 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
EFNB1P98172 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFNB1P98172 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFNB1P98172 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFNB1P98172 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNB1P98172 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNB1P98172 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFNB1P98172 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFNB1P98172 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFNB1P98172 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNB1P98172 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNB1P98172 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
EFNB1P98172 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EFNB1P98172 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNB1P98172 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNB1P98172 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EFNB1P98172 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNB1P98172 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EFNB1P98172 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNB1P98172 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
EFNB1P98172 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
EFNB1P98172 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNB1P98172 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EFNB1P98172 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNB1P98172 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNB1P98172 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNB1P98172 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
EFNB1P98172 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.27■■□□□ 1
EFNB1P98172 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNB1P98172 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
EFNB1P98172 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EFNB1P98172 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms