Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2BP67870 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK2BP67870 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK2BP67870 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms