Protein–RNA interactions for Protein: P67809

YBX1, Nuclease-sensitive element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1P67809 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX1P67809 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX1P67809 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX1P67809 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX1P67809 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX1P67809 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX1P67809 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX1P67809 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX1P67809 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YBX1P67809 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
YBX1P67809 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
YBX1P67809 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBX1P67809 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
YBX1P67809 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX1P67809 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
YBX1P67809 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX1P67809 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX1P67809 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX1P67809 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX1P67809 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX1P67809 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX1P67809 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YBX1P67809 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX1P67809 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX1P67809 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX1P67809 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX1P67809 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX1P67809 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YBX1P67809 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX1P67809 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX1P67809 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX1P67809 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX1P67809 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX1P67809 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX1P67809 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX1P67809 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX1P67809 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YBX1P67809 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YBX1P67809 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YBX1P67809 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YBX1P67809 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YBX1P67809 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
YBX1P67809 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YBX1P67809 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YBX1P67809 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
YBX1P67809 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YBX1P67809 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YBX1P67809 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YBX1P67809 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YBX1P67809 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YBX1P67809 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YBX1P67809 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YBX1P67809 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YBX1P67809 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YBX1P67809 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YBX1P67809 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YBX1P67809 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YBX1P67809 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YBX1P67809 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YBX1P67809 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YBX1P67809 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YBX1P67809 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YBX1P67809 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YBX1P67809 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YBX1P67809 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YBX1P67809 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms