Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERVK_113P63132 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HERVK_113P63132 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms