Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS25P62851 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS25P62851 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS25P62851 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPS25P62851 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS25P62851 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS25P62851 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS25P62851 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPS25P62851 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS25P62851 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS25P62851 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS25P62851 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS25P62851 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS25P62851 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPS25P62851 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS25P62851 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS25P62851 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPS25P62851 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS25P62851 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS25P62851 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS25P62851 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS25P62851 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS25P62851 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS25P62851 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS25P62851 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS25P62851 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPS25P62851 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS25P62851 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS25P62851 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS25P62851 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS25P62851 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS25P62851 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS25P62851 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS25P62851 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS25P62851 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS25P62851 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPS25P62851 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPS25P62851 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS25P62851 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS25P62851 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS25P62851 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS25P62851 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RPS25P62851 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPS25P62851 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPS25P62851 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPS25P62851 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPS25P62851 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPS25P62851 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
RPS25P62851 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPS25P62851 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPS25P62851 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPS25P62851 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RPS25P62851 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS25P62851 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS25P62851 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS25P62851 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS25P62851 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS25P62851 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS25P62851 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RPS25P62851 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS25P62851 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS25P62851 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS25P62851 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS25P62851 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS25P62851 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS25P62851 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS25P62851 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS25P62851 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS25P62851 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RPS25P62851 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS25P62851 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS25P62851 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS25P62851 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS25P62851 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RPS25P62851 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms