Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VBP1P61758 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VBP1P61758 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VBP1P61758 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VBP1P61758 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VBP1P61758 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VBP1P61758 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VBP1P61758 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VBP1P61758 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VBP1P61758 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VBP1P61758 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VBP1P61758 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VBP1P61758 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VBP1P61758 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VBP1P61758 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VBP1P61758 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VBP1P61758 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VBP1P61758 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VBP1P61758 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VBP1P61758 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VBP1P61758 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VBP1P61758 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VBP1P61758 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VBP1P61758 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VBP1P61758 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VBP1P61758 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VBP1P61758 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VBP1P61758 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VBP1P61758 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VBP1P61758 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
VBP1P61758 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VBP1P61758 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VBP1P61758 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VBP1P61758 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VBP1P61758 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VBP1P61758 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VBP1P61758 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VBP1P61758 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VBP1P61758 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VBP1P61758 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VBP1P61758 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
VBP1P61758 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VBP1P61758 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VBP1P61758 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VBP1P61758 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VBP1P61758 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VBP1P61758 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VBP1P61758 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VBP1P61758 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VBP1P61758 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VBP1P61758 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VBP1P61758 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VBP1P61758 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VBP1P61758 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VBP1P61758 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VBP1P61758 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VBP1P61758 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VBP1P61758 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VBP1P61758 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VBP1P61758 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VBP1P61758 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
VBP1P61758 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VBP1P61758 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VBP1P61758 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
VBP1P61758 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VBP1P61758 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VBP1P61758 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VBP1P61758 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VBP1P61758 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VBP1P61758 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VBP1P61758 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VBP1P61758 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VBP1P61758 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VBP1P61758 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms