Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAG2P55895 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAG2P55895 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAG2P55895 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAG2P55895 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAG2P55895 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAG2P55895 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAG2P55895 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAG2P55895 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAG2P55895 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAG2P55895 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAG2P55895 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAG2P55895 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAG2P55895 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAG2P55895 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAG2P55895 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAG2P55895 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAG2P55895 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAG2P55895 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAG2P55895 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAG2P55895 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAG2P55895 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAG2P55895 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAG2P55895 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAG2P55895 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAG2P55895 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAG2P55895 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAG2P55895 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAG2P55895 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAG2P55895 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAG2P55895 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAG2P55895 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAG2P55895 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAG2P55895 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAG2P55895 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAG2P55895 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAG2P55895 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAG2P55895 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAG2P55895 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAG2P55895 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAG2P55895 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAG2P55895 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAG2P55895 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAG2P55895 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAG2P55895 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAG2P55895 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAG2P55895 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAG2P55895 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAG2P55895 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAG2P55895 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAG2P55895 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RAG2P55895 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAG2P55895 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAG2P55895 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAG2P55895 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAG2P55895 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAG2P55895 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAG2P55895 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAG2P55895 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAG2P55895 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAG2P55895 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAG2P55895 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAG2P55895 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAG2P55895 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAG2P55895 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAG2P55895 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAG2P55895 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAG2P55895 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAG2P55895 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAG2P55895 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAG2P55895 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAG2P55895 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAG2P55895 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAG2P55895 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAG2P55895 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAG2P55895 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAG2P55895 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAG2P55895 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAG2P55895 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAG2P55895 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAG2P55895 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAG2P55895 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAG2P55895 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAG2P55895 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAG2P55895 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAG2P55895 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAG2P55895 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAG2P55895 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms