Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
AP2S1P53680 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
AP2S1P53680 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
AP2S1P53680 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms