Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2JP52435 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2JP52435 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms