Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALDH1A3P47895 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ALDH1A3P47895 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ALDH1A3P47895 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms