Protein–RNA interactions for Protein: P46013

MKI67, Proliferation marker protein Ki-67, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKI67P46013 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKI67P46013 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKI67P46013 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKI67P46013 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKI67P46013 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
MKI67P46013 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKI67P46013 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKI67P46013 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKI67P46013 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MKI67P46013 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKI67P46013 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKI67P46013 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKI67P46013 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKI67P46013 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKI67P46013 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKI67P46013 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKI67P46013 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MKI67P46013 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MKI67P46013 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MKI67P46013 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKI67P46013 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MKI67P46013 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKI67P46013 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKI67P46013 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKI67P46013 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKI67P46013 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKI67P46013 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MKI67P46013 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKI67P46013 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKI67P46013 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
MKI67P46013 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKI67P46013 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MKI67P46013 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKI67P46013 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKI67P46013 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MKI67P46013 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKI67P46013 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKI67P46013 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKI67P46013 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MKI67P46013 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MKI67P46013 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MKI67P46013 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKI67P46013 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKI67P46013 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKI67P46013 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MKI67P46013 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKI67P46013 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKI67P46013 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKI67P46013 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKI67P46013 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MKI67P46013 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKI67P46013 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKI67P46013 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MKI67P46013 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MKI67P46013 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MKI67P46013 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKI67P46013 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKI67P46013 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MKI67P46013 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MKI67P46013 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MKI67P46013 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKI67P46013 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKI67P46013 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKI67P46013 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKI67P46013 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKI67P46013 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKI67P46013 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MKI67P46013 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MKI67P46013 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKI67P46013 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKI67P46013 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKI67P46013 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKI67P46013 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MKI67P46013 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKI67P46013 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKI67P46013 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKI67P46013 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MKI67P46013 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKI67P46013 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKI67P46013 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKI67P46013 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKI67P46013 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKI67P46013 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MKI67P46013 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKI67P46013 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MKI67P46013 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKI67P46013 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKI67P46013 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKI67P46013 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKI67P46013 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKI67P46013 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKI67P46013 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKI67P46013 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
MKI67P46013 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKI67P46013 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKI67P46013 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKI67P46013 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKI67P46013 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MKI67P46013 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MKI67P46013 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms