Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP13P45452 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP13P45452 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP13P45452 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MMP13P45452 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP13P45452 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP13P45452 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP13P45452 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP13P45452 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP13P45452 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP13P45452 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MMP13P45452 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP13P45452 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP13P45452 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP13P45452 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP13P45452 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP13P45452 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MMP13P45452 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP13P45452 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP13P45452 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP13P45452 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP13P45452 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP13P45452 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP13P45452 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MMP13P45452 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP13P45452 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP13P45452 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP13P45452 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP13P45452 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP13P45452 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MMP13P45452 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP13P45452 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP13P45452 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP13P45452 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP13P45452 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MMP13P45452 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MMP13P45452 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP13P45452 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP13P45452 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP13P45452 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP13P45452 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP13P45452 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP13P45452 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP13P45452 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP13P45452 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MMP13P45452 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP13P45452 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP13P45452 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP13P45452 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP13P45452 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MMP13P45452 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP13P45452 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP13P45452 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP13P45452 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP13P45452 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MMP13P45452 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP13P45452 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP13P45452 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP13P45452 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP13P45452 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP13P45452 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP13P45452 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP13P45452 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MMP13P45452 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP13P45452 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP13P45452 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP13P45452 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP13P45452 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP13P45452 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP13P45452 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP13P45452 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MMP13P45452 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP13P45452 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP13P45452 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP13P45452 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MMP13P45452 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP13P45452 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP13P45452 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP13P45452 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP13P45452 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP13P45452 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP13P45452 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP13P45452 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP13P45452 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP13P45452 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP13P45452 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP13P45452 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP13P45452 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP13P45452 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP13P45452 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP13P45452 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP13P45452 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP13P45452 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP13P45452 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP13P45452 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP13P45452 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP13P45452 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP13P45452 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP13P45452 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP13P45452 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms