Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOLR3P41439 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FOLR3P41439 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.2 ms