Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR7P32248 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR7P32248 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR7P32248 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR7P32248 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR7P32248 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR7P32248 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR7P32248 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR7P32248 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR7P32248 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR7P32248 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCR7P32248 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR7P32248 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR7P32248 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR7P32248 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR7P32248 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR7P32248 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCR7P32248 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR7P32248 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR7P32248 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR7P32248 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR7P32248 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCR7P32248 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCR7P32248 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR7P32248 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR7P32248 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR7P32248 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR7P32248 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR7P32248 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR7P32248 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR7P32248 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR7P32248 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCR7P32248 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR7P32248 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR7P32248 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR7P32248 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR7P32248 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR7P32248 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR7P32248 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR7P32248 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR7P32248 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR7P32248 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR7P32248 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCR7P32248 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR7P32248 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR7P32248 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR7P32248 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR7P32248 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR7P32248 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR7P32248 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR7P32248 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR7P32248 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCR7P32248 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR7P32248 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR7P32248 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR7P32248 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR7P32248 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR7P32248 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR7P32248 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR7P32248 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR7P32248 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR7P32248 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCR7P32248 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR7P32248 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR7P32248 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR7P32248 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR7P32248 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCR7P32248 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR7P32248 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR7P32248 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR7P32248 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR7P32248 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR7P32248 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR7P32248 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR7P32248 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR7P32248 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCR7P32248 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR7P32248 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR7P32248 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR7P32248 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR7P32248 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR7P32248 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR7P32248 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR7P32248 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR7P32248 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR7P32248 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR7P32248 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR7P32248 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCR7P32248 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR7P32248 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR7P32248 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR7P32248 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR7P32248 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCR7P32248 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR7P32248 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms