Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXA10P31260 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA10P31260 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
HOXA10P31260 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
HOXA10P31260 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
HOXA10P31260 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA10P31260 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA10P31260 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA10P31260 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HOXA10P31260 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXA10P31260 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXA10P31260 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HOXA10P31260 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXA10P31260 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXA10P31260 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
HOXA10P31260 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms