Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD34P28906 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CD34P28906 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD34P28906 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD34P28906 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD34P28906 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD34P28906 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD34P28906 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD34P28906 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD34P28906 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD34P28906 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD34P28906 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CD34P28906 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD34P28906 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD34P28906 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD34P28906 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD34P28906 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CD34P28906 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD34P28906 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD34P28906 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD34P28906 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD34P28906 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CD34P28906 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CD34P28906 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD34P28906 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD34P28906 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD34P28906 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD34P28906 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD34P28906 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD34P28906 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD34P28906 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD34P28906 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD34P28906 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CD34P28906 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD34P28906 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CD34P28906 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD34P28906 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD34P28906 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD34P28906 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CD34P28906 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD34P28906 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD34P28906 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD34P28906 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CD34P28906 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD34P28906 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD34P28906 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD34P28906 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD34P28906 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD34P28906 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD34P28906 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CD34P28906 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD34P28906 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD34P28906 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD34P28906 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD34P28906 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD34P28906 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD34P28906 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD34P28906 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD34P28906 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CD34P28906 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD34P28906 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD34P28906 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD34P28906 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD34P28906 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD34P28906 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD34P28906 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD34P28906 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD34P28906 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD34P28906 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CD34P28906 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD34P28906 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD34P28906 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD34P28906 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD34P28906 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD34P28906 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD34P28906 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD34P28906 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD34P28906 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD34P28906 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD34P28906 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD34P28906 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD34P28906 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD34P28906 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD34P28906 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD34P28906 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD34P28906 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CD34P28906 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD34P28906 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD34P28906 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CD34P28906 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD34P28906 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD34P28906 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD34P28906 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD34P28906 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD34P28906 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD34P28906 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD34P28906 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD34P28906 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD34P28906 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD34P28906 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms