Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP1P28562 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DUSP1P28562 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms