Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLD1P28340 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
POLD1P28340 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLD1P28340 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLD1P28340 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
POLD1P28340 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLD1P28340 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
POLD1P28340 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLD1P28340 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
POLD1P28340 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
POLD1P28340 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLD1P28340 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
POLD1P28340 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
POLD1P28340 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLD1P28340 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
POLD1P28340 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
POLD1P28340 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
POLD1P28340 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLD1P28340 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLD1P28340 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
POLD1P28340 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
POLD1P28340 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLD1P28340 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLD1P28340 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLD1P28340 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLD1P28340 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
POLD1P28340 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLD1P28340 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLD1P28340 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLD1P28340 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLD1P28340 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
POLD1P28340 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLD1P28340 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLD1P28340 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLD1P28340 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLD1P28340 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
POLD1P28340 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLD1P28340 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLD1P28340 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLD1P28340 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLD1P28340 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLD1P28340 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
POLD1P28340 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
POLD1P28340 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
POLD1P28340 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLD1P28340 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLD1P28340 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLD1P28340 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLD1P28340 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLD1P28340 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
POLD1P28340 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLD1P28340 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLD1P28340 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLD1P28340 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLD1P28340 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
POLD1P28340 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLD1P28340 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
POLD1P28340 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLD1P28340 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
POLD1P28340 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLD1P28340 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
POLD1P28340 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLD1P28340 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
POLD1P28340 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLD1P28340 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLD1P28340 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLD1P28340 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
POLD1P28340 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLD1P28340 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLD1P28340 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLD1P28340 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLD1P28340 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLD1P28340 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLD1P28340 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
POLD1P28340 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLD1P28340 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
POLD1P28340 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
POLD1P28340 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLD1P28340 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
POLD1P28340 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
POLD1P28340 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
POLD1P28340 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLD1P28340 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
POLD1P28340 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLD1P28340 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLD1P28340 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLD1P28340 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLD1P28340 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
POLD1P28340 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLD1P28340 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLD1P28340 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLD1P28340 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
POLD1P28340 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLD1P28340 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLD1P28340 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
POLD1P28340 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLD1P28340 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLD1P28340 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
POLD1P28340 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
POLD1P28340 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms