Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARF4P18085 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARF4P18085 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARF4P18085 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARF4P18085 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARF4P18085 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARF4P18085 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARF4P18085 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARF4P18085 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARF4P18085 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARF4P18085 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARF4P18085 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARF4P18085 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARF4P18085 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARF4P18085 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARF4P18085 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARF4P18085 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARF4P18085 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARF4P18085 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARF4P18085 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARF4P18085 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARF4P18085 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ARF4P18085 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARF4P18085 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARF4P18085 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARF4P18085 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARF4P18085 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARF4P18085 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARF4P18085 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARF4P18085 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARF4P18085 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARF4P18085 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARF4P18085 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARF4P18085 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARF4P18085 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARF4P18085 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARF4P18085 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARF4P18085 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARF4P18085 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARF4P18085 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARF4P18085 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARF4P18085 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARF4P18085 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARF4P18085 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARF4P18085 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARF4P18085 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ARF4P18085 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARF4P18085 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARF4P18085 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARF4P18085 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARF4P18085 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARF4P18085 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARF4P18085 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARF4P18085 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ARF4P18085 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARF4P18085 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ARF4P18085 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARF4P18085 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARF4P18085 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARF4P18085 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARF4P18085 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARF4P18085 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARF4P18085 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARF4P18085 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARF4P18085 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARF4P18085 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARF4P18085 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARF4P18085 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARF4P18085 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARF4P18085 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARF4P18085 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARF4P18085 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARF4P18085 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARF4P18085 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARF4P18085 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARF4P18085 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARF4P18085 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARF4P18085 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARF4P18085 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ARF4P18085 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARF4P18085 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARF4P18085 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARF4P18085 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARF4P18085 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARF4P18085 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARF4P18085 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARF4P18085 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARF4P18085 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARF4P18085 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARF4P18085 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARF4P18085 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARF4P18085 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARF4P18085 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARF4P18085 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARF4P18085 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARF4P18085 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARF4P18085 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARF4P18085 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARF4P18085 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARF4P18085 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms