Protein–RNA interactions for Protein: P10398

ARAF, Serine/threonine-protein kinase A-Raf, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAFP10398 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARAFP10398 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARAFP10398 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARAFP10398 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARAFP10398 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARAFP10398 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARAFP10398 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARAFP10398 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARAFP10398 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARAFP10398 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARAFP10398 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARAFP10398 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARAFP10398 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARAFP10398 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARAFP10398 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARAFP10398 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARAFP10398 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARAFP10398 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARAFP10398 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARAFP10398 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARAFP10398 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARAFP10398 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARAFP10398 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARAFP10398 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARAFP10398 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARAFP10398 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARAFP10398 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARAFP10398 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARAFP10398 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARAFP10398 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARAFP10398 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARAFP10398 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARAFP10398 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARAFP10398 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARAFP10398 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARAFP10398 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARAFP10398 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARAFP10398 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARAFP10398 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARAFP10398 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARAFP10398 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARAFP10398 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARAFP10398 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARAFP10398 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARAFP10398 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARAFP10398 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARAFP10398 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARAFP10398 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARAFP10398 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARAFP10398 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARAFP10398 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARAFP10398 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ARAFP10398 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARAFP10398 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARAFP10398 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARAFP10398 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARAFP10398 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARAFP10398 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARAFP10398 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARAFP10398 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARAFP10398 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARAFP10398 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARAFP10398 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARAFP10398 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARAFP10398 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARAFP10398 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARAFP10398 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARAFP10398 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARAFP10398 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARAFP10398 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARAFP10398 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARAFP10398 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARAFP10398 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARAFP10398 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARAFP10398 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARAFP10398 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARAFP10398 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARAFP10398 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARAFP10398 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARAFP10398 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARAFP10398 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARAFP10398 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARAFP10398 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARAFP10398 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARAFP10398 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARAFP10398 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARAFP10398 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms