Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF888P0CJ79 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF888P0CJ79 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF888P0CJ79 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.4 ms