Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NGFRP08138 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NGFRP08138 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NGFRP08138 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NGFRP08138 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NGFRP08138 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NGFRP08138 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NGFRP08138 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NGFRP08138 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NGFRP08138 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NGFRP08138 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NGFRP08138 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NGFRP08138 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NGFRP08138 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NGFRP08138 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NGFRP08138 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NGFRP08138 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NGFRP08138 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NGFRP08138 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NGFRP08138 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NGFRP08138 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NGFRP08138 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NGFRP08138 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGFRP08138 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGFRP08138 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGFRP08138 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGFRP08138 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGFRP08138 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGFRP08138 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGFRP08138 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGFRP08138 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGFRP08138 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGFRP08138 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGFRP08138 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NGFRP08138 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGFRP08138 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGFRP08138 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGFRP08138 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGFRP08138 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGFRP08138 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGFRP08138 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGFRP08138 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NGFRP08138 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGFRP08138 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGFRP08138 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGFRP08138 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NGFRP08138 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGFRP08138 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGFRP08138 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGFRP08138 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGFRP08138 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGFRP08138 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGFRP08138 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NGFRP08138 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGFRP08138 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGFRP08138 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGFRP08138 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NGFRP08138 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
NGFRP08138 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NGFRP08138 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NGFRP08138 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NGFRP08138 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NGFRP08138 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NGFRP08138 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NGFRP08138 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NGFRP08138 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NGFRP08138 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NGFRP08138 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NGFRP08138 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NGFRP08138 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NGFRP08138 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NGFRP08138 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NGFRP08138 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NGFRP08138 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGFRP08138 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGFRP08138 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGFRP08138 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGFRP08138 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGFRP08138 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGFRP08138 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGFRP08138 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGFRP08138 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NGFRP08138 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NGFRP08138 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms