Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV3-11P04433 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV3-11P04433 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
IGKV3-11P04433 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV3-11P04433 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms