Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB1P04280 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB1P04280 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB1P04280 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB1P04280 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB1P04280 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB1P04280 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB1P04280 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB1P04280 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRB1P04280 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRB1P04280 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRB1P04280 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRB1P04280 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRB1P04280 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRB1P04280 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRB1P04280 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRB1P04280 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRB1P04280 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRB1P04280 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRB1P04280 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRB1P04280 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRB1P04280 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRB1P04280 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRB1P04280 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRB1P04280 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRB1P04280 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRB1P04280 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRB1P04280 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRB1P04280 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRB1P04280 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRB1P04280 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRB1P04280 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRB1P04280 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRB1P04280 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRB1P04280 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRB1P04280 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRB1P04280 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRB1P04280 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRB1P04280 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRB1P04280 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRB1P04280 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRB1P04280 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRB1P04280 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRB1P04280 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRB1P04280 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRB1P04280 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRB1P04280 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRB1P04280 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRB1P04280 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRB1P04280 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRB1P04280 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRB1P04280 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRB1P04280 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRB1P04280 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRB1P04280 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRB1P04280 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRB1P04280 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRB1P04280 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRB1P04280 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRB1P04280 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRB1P04280 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRB1P04280 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRB1P04280 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRB1P04280 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRB1P04280 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRB1P04280 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB1P04280 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB1P04280 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB1P04280 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB1P04280 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB1P04280 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB1P04280 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB1P04280 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB1P04280 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB1P04280 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB1P04280 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB1P04280 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRB1P04280 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRB1P04280 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRB1P04280 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRB1P04280 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRB1P04280 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRB1P04280 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRB1P04280 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRB1P04280 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRB1P04280 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB1P04280 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB1P04280 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB1P04280 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB1P04280 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB1P04280 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB1P04280 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRB1P04280 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB1P04280 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB1P04280 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB1P04280 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB1P04280 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB1P04280 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB1P04280 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRB1P04280 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms