Protein–RNA interactions for Protein: O95639

CPSF4, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF4O95639 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CPSF4O95639 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPSF4O95639 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPSF4O95639 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms