Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLDN7O95471 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLDN7O95471 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN7O95471 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms