Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG12O94817 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
ATG12O94817 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG12O94817 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG12O94817 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG12O94817 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG12O94817 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ATG12O94817 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG12O94817 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG12O94817 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG12O94817 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG12O94817 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG12O94817 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG12O94817 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG12O94817 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ATG12O94817 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG12O94817 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG12O94817 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ATG12O94817 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG12O94817 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG12O94817 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG12O94817 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ATG12O94817 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG12O94817 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG12O94817 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG12O94817 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG12O94817 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG12O94817 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG12O94817 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG12O94817 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ATG12O94817 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG12O94817 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ATG12O94817 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG12O94817 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG12O94817 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG12O94817 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ATG12O94817 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG12O94817 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG12O94817 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG12O94817 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG12O94817 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG12O94817 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG12O94817 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG12O94817 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG12O94817 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG12O94817 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ATG12O94817 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG12O94817 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG12O94817 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG12O94817 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG12O94817 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG12O94817 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG12O94817 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG12O94817 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ATG12O94817 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG12O94817 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG12O94817 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG12O94817 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG12O94817 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG12O94817 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG12O94817 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG12O94817 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG12O94817 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG12O94817 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG12O94817 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ATG12O94817 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ATG12O94817 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG12O94817 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG12O94817 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG12O94817 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG12O94817 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG12O94817 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG12O94817 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG12O94817 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ATG12O94817 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG12O94817 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG12O94817 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG12O94817 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG12O94817 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG12O94817 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG12O94817 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG12O94817 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG12O94817 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG12O94817 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG12O94817 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG12O94817 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ATG12O94817 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG12O94817 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG12O94817 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG12O94817 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG12O94817 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG12O94817 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG12O94817 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG12O94817 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG12O94817 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG12O94817 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG12O94817 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG12O94817 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ATG12O94817 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ATG12O94817 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms