Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
BBOX1O75936 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BBOX1O75936 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BBOX1O75936 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
BBOX1O75936 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms