Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRGAP2O75044 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRGAP2O75044 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms