Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNCRIPO60506 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SYNCRIPO60506 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYNCRIPO60506 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms