Protein–RNA interactions for Protein: O60488

ACSL4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL4O60488 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSL4O60488 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSL4O60488 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACSL4O60488 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACSL4O60488 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ACSL4O60488 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ACSL4O60488 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms