Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX16O60231 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX16O60231 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX16O60231 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX16O60231 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX16O60231 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX16O60231 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX16O60231 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX16O60231 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX16O60231 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX16O60231 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX16O60231 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX16O60231 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX16O60231 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
DHX16O60231 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DHX16O60231 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DHX16O60231 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
DHX16O60231 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX16O60231 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX16O60231 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX16O60231 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX16O60231 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DHX16O60231 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
DHX16O60231 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
DHX16O60231 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
DHX16O60231 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX16O60231 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX16O60231 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX16O60231 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX16O60231 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX16O60231 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX16O60231 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX16O60231 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX16O60231 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
DHX16O60231 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DHX16O60231 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DHX16O60231 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DHX16O60231 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DHX16O60231 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DHX16O60231 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX16O60231 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX16O60231 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX16O60231 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX16O60231 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX16O60231 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX16O60231 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DHX16O60231 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DHX16O60231 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DHX16O60231 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DHX16O60231 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DHX16O60231 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DHX16O60231 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DHX16O60231 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX16O60231 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
DHX16O60231 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DHX16O60231 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DHX16O60231 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DHX16O60231 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DHX16O60231 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DHX16O60231 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX16O60231 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX16O60231 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX16O60231 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DHX16O60231 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX16O60231 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX16O60231 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX16O60231 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX16O60231 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX16O60231 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX16O60231 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX16O60231 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX16O60231 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX16O60231 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX16O60231 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX16O60231 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DHX16O60231 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX16O60231 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX16O60231 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DHX16O60231 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX16O60231 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX16O60231 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX16O60231 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DHX16O60231 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX16O60231 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX16O60231 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX16O60231 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX16O60231 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX16O60231 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX16O60231 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX16O60231 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX16O60231 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX16O60231 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DHX16O60231 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX16O60231 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX16O60231 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX16O60231 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX16O60231 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX16O60231 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX16O60231 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DHX16O60231 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.1 ms