Protein–RNA interactions for Protein: O43752

STX6, Syntaxin-6, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX6O43752 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STX6O43752 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STX6O43752 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
STX6O43752 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX6O43752 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX6O43752 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX6O43752 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX6O43752 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX6O43752 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX6O43752 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
STX6O43752 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STX6O43752 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STX6O43752 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STX6O43752 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
STX6O43752 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
STX6O43752 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX6O43752 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX6O43752 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX6O43752 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
STX6O43752 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX6O43752 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
STX6O43752 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX6O43752 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX6O43752 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX6O43752 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX6O43752 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
STX6O43752 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
STX6O43752 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
STX6O43752 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
STX6O43752 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
STX6O43752 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STX6O43752 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
STX6O43752 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
STX6O43752 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STX6O43752 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
STX6O43752 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
STX6O43752 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.55■■■□□ 2
STX6O43752 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STX6O43752 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.55■■■□□ 2
STX6O43752 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
STX6O43752 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STX6O43752 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STX6O43752 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
STX6O43752 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STX6O43752 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
STX6O43752 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
STX6O43752 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STX6O43752 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STX6O43752 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STX6O43752 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
STX6O43752 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
STX6O43752 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STX6O43752 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STX6O43752 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STX6O43752 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STX6O43752 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
STX6O43752 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
STX6O43752 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
STX6O43752 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
STX6O43752 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
STX6O43752 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX6O43752 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX6O43752 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX6O43752 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX6O43752 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX6O43752 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX6O43752 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX6O43752 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
STX6O43752 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STX6O43752 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STX6O43752 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STX6O43752 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
STX6O43752 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
STX6O43752 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STX6O43752 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STX6O43752 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STX6O43752 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STX6O43752 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
STX6O43752 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
STX6O43752 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
STX6O43752 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
STX6O43752 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
STX6O43752 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms