Protein–RNA interactions for Protein: O43736

ITM2A, Integral membrane protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITM2AO43736 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ITM2AO43736 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITM2AO43736 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITM2AO43736 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms