Protein–RNA interactions for Protein: O15260

SURF4, Surfeit locus protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF4O15260 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SURF4O15260 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SURF4O15260 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SURF4O15260 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SURF4O15260 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SURF4O15260 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SURF4O15260 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SURF4O15260 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SURF4O15260 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SURF4O15260 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SURF4O15260 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SURF4O15260 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SURF4O15260 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SURF4O15260 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SURF4O15260 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SURF4O15260 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SURF4O15260 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SURF4O15260 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SURF4O15260 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SURF4O15260 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SURF4O15260 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SURF4O15260 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SURF4O15260 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SURF4O15260 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SURF4O15260 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SURF4O15260 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SURF4O15260 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SURF4O15260 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SURF4O15260 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SURF4O15260 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SURF4O15260 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SURF4O15260 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SURF4O15260 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SURF4O15260 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SURF4O15260 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SURF4O15260 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SURF4O15260 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SURF4O15260 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SURF4O15260 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SURF4O15260 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SURF4O15260 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SURF4O15260 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SURF4O15260 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SURF4O15260 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SURF4O15260 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SURF4O15260 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SURF4O15260 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SURF4O15260 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SURF4O15260 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SURF4O15260 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SURF4O15260 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SURF4O15260 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SURF4O15260 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SURF4O15260 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SURF4O15260 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SURF4O15260 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SURF4O15260 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SURF4O15260 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SURF4O15260 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SURF4O15260 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SURF4O15260 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SURF4O15260 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SURF4O15260 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SURF4O15260 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SURF4O15260 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SURF4O15260 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SURF4O15260 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SURF4O15260 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SURF4O15260 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SURF4O15260 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SURF4O15260 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SURF4O15260 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SURF4O15260 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SURF4O15260 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SURF4O15260 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SURF4O15260 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SURF4O15260 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SURF4O15260 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SURF4O15260 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SURF4O15260 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SURF4O15260 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SURF4O15260 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms