Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DCLK1O15075 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DCLK1O15075 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DCLK1O15075 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms