Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASGRF2O14827 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RASGRF2O14827 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASGRF2O14827 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms