Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAFD1O14545 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRAFD1O14545 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRAFD1O14545 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 273.5 ms