Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KR12 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KR12 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KR12 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KR12 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KR12 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KR12 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KR12 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KR12 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KR12 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KR12 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KR12 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
J3KR12 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
J3KR12 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
J3KR12 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
J3KR12 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
J3KR12 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
J3KR12 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
J3KR12 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
J3KR12 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
J3KR12 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
J3KR12 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
J3KR12 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
J3KR12 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
J3KR12 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
J3KR12 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
J3KR12 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3KR12 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3KR12 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3KR12 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
J3KR12 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3KR12 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3KR12 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3KR12 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
J3KR12 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3KR12 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3KR12 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3KR12 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3KR12 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3KR12 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3KR12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3KR12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3KR12 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3KR12 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
J3KR12 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
J3KR12 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
J3KR12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
J3KR12 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
J3KR12 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
J3KR12 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
J3KR12 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
J3KR12 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
J3KR12 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
J3KR12 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
J3KR12 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
J3KR12 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
J3KR12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
J3KR12 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
J3KR12 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
J3KR12 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
J3KR12 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
J3KR12 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
J3KR12 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
J3KR12 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3KR12 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3KR12 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3KR12 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3KR12 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
J3KR12 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3KR12 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3KR12 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3KR12 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
J3KR12 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
J3KR12 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
J3KR12 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3KR12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3KR12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3KR12 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3KR12 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
J3KR12 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
J3KR12 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
J3KR12 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
J3KR12 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
J3KR12 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
J3KR12 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
J3KR12 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
J3KR12 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
J3KR12 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms