Protein–RNA interactions for Protein: H7C350

CCDC188, Coiled-coil domain-containing protein 188, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC188H7C350 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC188H7C350 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC188H7C350 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC188H7C350 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms