Protein–RNA interactions for Protein: H7C1W4

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1W4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
H7C1W4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
H7C1W4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
H7C1W4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
H7C1W4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
H7C1W4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
H7C1W4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
H7C1W4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
H7C1W4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
H7C1W4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
H7C1W4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
H7C1W4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
H7C1W4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
H7C1W4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
H7C1W4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
H7C1W4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
H7C1W4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
H7C1W4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
H7C1W4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
H7C1W4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
H7C1W4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
H7C1W4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
H7C1W4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
H7C1W4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
H7C1W4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
H7C1W4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
H7C1W4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
H7C1W4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
H7C1W4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1W4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1W4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1W4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1W4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1W4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1W4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
H7C1W4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
H7C1W4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
H7C1W4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
H7C1W4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
H7C1W4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
H7C1W4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
H7C1W4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
H7C1W4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
H7C1W4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
H7C1W4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
H7C1W4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1W4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1W4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1W4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1W4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1W4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
H7C1W4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
H7C1W4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
H7C1W4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
H7C1W4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
H7C1W4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
H7C1W4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
H7C1W4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
H7C1W4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
H7C1W4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
H7C1W4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
H7C1W4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
H7C1W4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
H7C1W4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
H7C1W4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
H7C1W4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
H7C1W4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
H7C1W4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
H7C1W4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
H7C1W4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
H7C1W4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1W4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1W4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1W4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1W4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1W4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1W4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1W4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1W4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1W4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
H7C1W4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
H7C1W4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
H7C1W4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
H7C1W4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
H7C1W4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
H7C1W4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
H7C1W4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
H7C1W4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
H7C1W4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
H7C1W4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
H7C1W4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
H7C1W4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
H7C1W4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
H7C1W4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
H7C1W4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
H7C1W4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
H7C1W4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1W4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1W4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.67■■■□□ 2.34
H7C1W4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms