Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4DGG1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4DGG1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4DGG1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
B4DGG1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DGG1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DGG1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DGG1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DGG1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DGG1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DGG1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
B4DGG1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4DGG1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4DGG1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4DGG1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4DGG1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4DGG1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
B4DGG1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DGG1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DGG1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DGG1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DGG1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DGG1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DGG1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DGG1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DGG1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DGG1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
B4DGG1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B4DGG1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B4DGG1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
B4DGG1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
B4DGG1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DGG1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DGG1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DGG1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DGG1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DGG1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DGG1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DGG1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DGG1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
B4DGG1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
B4DGG1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
B4DGG1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
B4DGG1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B4DGG1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
B4DGG1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B4DGG1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
B4DGG1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
B4DGG1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B4DGG1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
B4DGG1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
B4DGG1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
B4DGG1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4DGG1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4DGG1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4DGG1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4DGG1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4DGG1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4DGG1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
B4DGG1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
B4DGG1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DGG1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DGG1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DGG1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DGG1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DGG1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DGG1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DGG1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DGG1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
B4DGG1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4DGG1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4DGG1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4DGG1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
B4DGG1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
B4DGG1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4DGG1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4DGG1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4DGG1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
B4DGG1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
B4DGG1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4DGG1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4DGG1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4DGG1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4DGG1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
B4DGG1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DGG1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DGG1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
B4DGG1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms