Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCT8L1PA6NM43 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCT8L1PA6NM43 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCT8L1PA6NM43 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms