Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ88

SAGE2P, Putative SAGE1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAGE2PA6NJ88 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SAGE2PA6NJ88 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SAGE2PA6NJ88 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SAGE2PA6NJ88 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms