Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP73A6NFT4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CFAP73A6NFT4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CFAP73A6NFT4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CFAP73A6NFT4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms